1585(天正13)年、羽柴秀吉の命により中村一氏が甲賀郡の支配の拠点として古城山に築城した。この山は古くは､大岡山あるいは岡山と呼ばれていた。その後、1590(天正18)年に増田長盛が、1595(文禄4)年には長束正家と五奉行を務めた2人が相次いで入城している。
　1600(慶長5)年の関ヶ原の戦いでは長束正家は西軍に属し、南宮山麓に布陣していたが戦闘には参加できず敗走。水口岡山城に籠城したが､追ってきた池田長吉,亀井茲矩らに攻められて降伏、開城し、長束正家,直吉兄弟は切腹させられた。城はその後､池田長吉の預かりとなったが、廃城となった。城の石垣は後に水口城の築城に部材として転用されている。
　城は独立峰である大岡山(古城山)の尾根を利用した連郭式山城で、三の丸推定地に居住施設があったが、後に山麓に居住施設が移動した。普段はそこを政庁として利用し、山上の主郭部は緊急用であったと推定される。山頂部にある本丸主郭には東西両端に礎石が残り、両側に天守クラスの大型の高層建築物建ち、総石垣であったとされる。