一条朝末から三条朝で兵衛尉,衛門尉を歴任し、長和5年(1016年)後一条天皇の践祚に伴って六位蔵人に任ぜられた。まもなく、五位に叙せられて阿波守に転じると、寛仁元年(1017年)ごろ阿波守、万寿4年(1027年)備中守と受領を歴任する。長元3年(1030年)には応天門･東西廊32間･東西楼を造営した功労を理由に備中守の任期1年延長の申請が認められている。
　長久元年(1040年)讃岐国において、貢進物の未済や官物徴集に関連した百姓による愁訴を理由に、後朱雀天皇の判断により讃岐守･藤原憲房が解任される。後任の国守には、備前前司･源為善らが希望を挙げるが、関白･藤原頼通の意向で邦恒が任ぜられた。永承3年(1048年)讃岐守の任期を終えて功過定が行われて邦恒は不与解由状を提出するが、不与状に問題があったらしく、不与状は読まれないまま定文が書かれてしまい、参議･藤原資房から批判を受けている。
　永承2年(1047年)～同3年(1048年)にかけて藤原隆佐や高階業敏とともに藤原頼通の家司として、興福寺の造営と供養に多大な奉仕を行う。さらに、康平元年(1058年)に焼失した法性寺の再建･供養にも奉仕した。またこの間の天喜年間(1053～1058年)には西院の自邸に仏堂(西院邦恒堂)を造営し、定朝の手による丈六阿弥陀仏を収めた。仏堂はその壮麗さが驚嘆され、仏像は｢天下是を以て仏本様と為す｣と賞賛された。
　そのほかにも、尾張守,備後守,丹波守(または丹後守),伊予守と後一条･後朱雀･後冷泉の三朝40年以上に亘って受領を務め、位階は正四位下に至った。治暦3年(1067年)8月19日卒去。享年82。
　摂関家の家司として権力を背景に受領を歴任し、受領として蓄えた財力で摂関家への奉仕や造寺造仏も行う、典型的な家司受領と評価されている。