尹澄の代に元弘の争乱が起こった。尹澄は河内の楠木正成の妹を娶っていた関係から、子の安澄とともに正成に属して千早赤坂城に籠って幕府軍と戦った。隣接する隅田庄の隅田一族は幕府方として活動しており、尹澄らは隅田氏との抗争を続けた。やがて、幕府が滅亡して後醍醐天皇の親政による建武の新政が開始された。しかし、新政は足利尊氏の謀叛によって崩壊、南北朝の対立時代を迎えると尹澄・安澄父子は楠木正成とともに南朝方として行動した。
　建武3年(1336)、九州で再挙を図った足利尊氏が西上の軍を起こすと、尹澄は正成とともに摂津湊川で尊氏軍を迎え撃った。そして、尹澄は正成とともに華々しく討死した。