築城年代は定かではないが、1582(天正10)年頃の城主は長谷川五郎右衛門と伝えられる。五郎右衛門は、本能寺の変に乗じて森長可の金山城に攻めかかったが、逆に滅ぼされたとされている。
上恵土城は本郷公民館の南側一帯に築かれていた。この辺りは｢大屋敷｣,｢小屋敷｣と呼ばれており、東西に小規模ながら｢大屋敷｣の南辺の土塁が現存している。