1951(昭和26)年、古くから大久保の地にあった日吉神社,神明宮,進雄神社,稲荷神社を合祀し、大窪神社となった。この境内は江戸時代には大久保陣屋(代官屋敷)で馬渕恒蔵氏の所有であったが、4神社統合時に大窪神社に寄贈された。石垣は陣屋時代のままである。なお、銅葺き屋根の社殿は、1989(平成元)年に新築されたものである。